- 調查分析
- 農情調查業務之協助與督導。
- 農糧產業天然災害查報與救助之協助與督導。
- 農糧產品生產成本及價格調查之協助及督導。
- 國內農糧產業經濟情勢資料蒐集及分析。
- 雜糧特作
- 主要及敏感性雜糧特作產地價格及市價行情查報。
- 主要及敏感性雜糧特作產銷資訊蒐集及預警。
- 敏感性雜糧特作產銷失衡促銷及購貯計畫執行。
- 雜糧特作產銷輔導計畫執行。
- 蔬菜花卉
- 蔬菜花卉產地價格與市價行情查報。
- 蔬菜花卉產銷資訊蒐集及預警。
- 蔬菜花卉產銷失衡促銷及購貯計畫執行。
- 蔬菜花卉產銷輔導計畫執行。
- 果樹產業
- 果樹產業產地價格及市價行情查報。
- 果樹產業產銷資訊蒐集及預警。
- 果樹產業產銷失衡促銷及購貯計畫執行。
- 果樹產業產銷輔導計畫執行。
- 種苗管理
- 種苗管理產銷輔導計畫執行。
- 種苗驗證體系之執行。
- 種子種苗檢查及取樣。
- 資訊業務
- 本分署農糧資訊發展之策略規劃、聯繫及協調。
- 本分署農糧資訊網站、資料庫之規劃、建置、維護及推廣應用。
- 有關電腦軟硬體維修、應用諮詢及技術支援。
- 本分署業務電腦化、資訊教育與通訊安全之計畫擬訂與執行。
- 其他有關農糧資訊事項。

作物生產課
農業資材課
- 作物環境
- 安全用藥及吉圓圃認證相關計劃之推動與督導。
- 養蜂輔導工作之推動與督導。
- 有機農產品及認證之輔導。
- 農業機械
- 農業機械及自動化發展相關計劃之執行與督導。
- 農作物栽培及調製之動力用電協調管理。
- 土壤肥料
- 土壤肥料管理及推廣相關計劃之輔導與執行。
- 綠肥作物之推廣。
- 農作物公害案件之協助查處及重金屬污染監測管制。
運銷加工課
- 市場管理
- 果菜、花卉批發市場基本及交易資料查報。
- 果菜、花卉等農產品批發市場經營管理與交易制度之輔導。
- 農產品合作運銷組訓、集貨分級包裝儲運保鮮之輔導。
- 農產運銷設施、作業技術充實與改進之輔導。
- 行銷輔導
- 農產品行銷訓練之輔導與執行。
- 地區性農產品宣傳、推廣與促銷之輔導。
- 農產品認證制度與品牌建立等之輔導。
- 輔導建立農產品物流、直銷體系。
- 「推動農村再生中程計畫-運銷設施」之輔導。
- 農產加工
- 協助加工型農產品產銷資訊蒐集。
- 輔導地區性農產品加工品推廣、促銷。
- 農產品加工廠設施之督導及建立加工品通路之輔導。
- 地區性農村釀酒原料生產品質之輔導。
- 農產品加工品行銷通路拓展與宣傳、廣告、促銷之輔導。
糧食產業課
- 糧食管理
- 糧價調查業務之執行。
- 糧商及農會收購稻穀貸款計畫之執行。
- 糧食調節措施與價格穩定計畫之推動。
- 稻農現金救助之執行。糧商管理業務之執行。
- 糧食生產
- 水旱田利用調整計畫之推動。
- 污染農地停耕補償事宜之執行。
- 水稻育苗中心營運調適之執行。
- 稻作耕作制度改善及擴大經營規模之執行。
- 稻作生產量調查、航側面積建檔與統計分析之執行。
- 稻米產銷計畫之執行。良質米生產輔導之推動與執行。
- 水旱田輪作、休耕補貼經費之核發與資料建檔之執行。
- 有機米生產之推動與執行。稻米產銷班之推動與執行。
- 糧食經營
- 米榖檢驗人員訓練計畫之管理。
- 稻米衛生安全檢驗方案之執行。
- 稻米品質調查計畫之策劃與督導。
- 稻米產銷策略聯盟計畫之執行與推動。
- 米食與優良食米推廣計畫之執行與推動。
- 米製食品加工技術研究發展之執行與推動。
- 稻米品質競賽計畫之執行。CAS良質米認證之執行。
- 市售食米抽檢計畫之執行。糧食業者品管制度之輔導。
- 稻米及米製品產業經營與行銷輔導工作之執行與推動 。
- 糧食檢驗法規及檢驗制度之執行。稻米品質檢驗之執行。
- 輔導農會及糧食業者申請變更農業用地興建碾米相關設備作業之執行。
糧食儲運課
- 糧食收購
- 辦理稻米保價收購計劃之執行。
- 辦理天然災害稻穀之收購與處理。
- 補助公糧稻穀隨糧包袋費用之核撥。
- 督導省農會執行高梁與飼料玉米保價收購與銷售計劃。
- 農戶耕地資料之建檔。水旱田輪作、休耕資料之建檔。
- 倉儲管理
- 公糧倉庫與倉儲設備興修建計劃之執行。
- 糧食倉儲制度之執行。公糧委託業務各項費用之核撥。
- 公糧委託倉庫之管理。公糧委託業務違約案件之處理。
- 公糧收儲倉容之檢討與籌措。公糧倉儲管理與庫存量查核。公糧倉儲損耗核銷、蟲鼠害防治及災害處理。
- 糧食供銷
- 公糧收撥計劃之執行。公糧供銷業務之執行。
- 出口與援外糧食之調撥加工。
- 公糧加工計劃之訂定與執行。
- 緊急時期糧食供應之執行。糧食動員計劃之演習與執行。
- 公糧運輸業務之委託與公糧調撥。進口公糧倉容之籌措與倉儲管理。公糧包裝資材供需計劃之執行。
秘書室
- 綜合業務
- 機要案件處理及法規彙整。
- 首長移交政績交代之彙報。
- 媒體聯繫協調及新聞稿件發布。
- 動員計畫之擬議、執行及物力調查彙報。
- 綜合計畫報告之審議或編撰。交辦事項處理。
- 有關處務會議業務會報等議事工作之處理及紀錄之核定。
- 研究發展及革新便民
- 便民工作及申請案件之管制考核。
- 計畫與執行進度之追蹤查證及管制。
- 研究發展報告之訂定、評審及處理。
- 行政革新重點項目之選定評核及彙整。
- 便民工作之策劃。便民業務之協調及督導。
- 管制考核
- 業務執行之追蹤管制。
- 民意機關決議案件彙辦。
- 業務管制考核工作之規劃及聯繫協調。
- 重要案件及其他各種會議案件交辦事項。
- 公文之追蹤、稽核。 各項定期表報之彙整。
- 印信典守
印信申請、保管及繳銷保管。文稿之用印。
- 文書及檔案管理
- 公文之收發、繕校及登錄統計。
- 郵資報支。密件保管。檔案清理銷燬。
- 文件點收、整理、分類、歸檔及借調。
- 出納管理
- 有關證卷支票之收付與保管。
- 各項款項之收入、支付及解繳。
- 員工薪津及各項獎金印領清冊及所得保險費等扣繳及申報。
- 財產管理
- 財產之編報及財產減損、報廢之處理。
- 財產之驗收與分配或核借。房屋車輛之投保。
- 辦公廳舍及財產管理。房地產權之登記和保險。
- 不動產動態報告表隻編報。物品驗收登記及核發與盤點。
- 物品採購
- 零用金限額以上之工程、財務、勞務之採購。
- 零用金限額以下之工程、財務、勞務之採購。
- 車輛管理
- 公務車之購置及報廢。油料之保管及核發。
- 公務車之管理調配。車輛保養、維修。車輛肇事之調查及處理。
- 工友管理
- 工友工作分配及勤惰管理。
- 駕駛、技工、工友之僱免。
- 駕駛、技工、工友三日以上之差假。
- 駕駛、技工、工友撫恤退職案件之核轉。
- 駕駛、技工、工友三日以內差假之核定。
- 駕駛、技工、工友年終考核。勞健保險投保及退保。
- 辦公廳舍管理
- 宿舍之回收及糾紛處理。
- 集會管理及會場佈置與商借。
- 辦公處所管理及佈置整修美化。
- 租賃契約及公證手續之辦理及核轉。
- 宿舍管理與分配。水電、電話之管理。
- 辦公廳舍、倉庫及基地租用之擬議及核轉。
- 營繕工程
- 工程之比價招標訂約及核轉。
- 工程之監工、施工、管理、督導。
- 工程之驗收結算及工程款項請撥。
- 工程底價之核定。工程計畫預算之擬訂與核轉。
- 防護管理
- 防護計畫之擬定與執行。
- 防護設備及器材之管理。災害之搶救及善後之處理。
人事室
- 組織編制
- 組織編制事項之擬議。
- 權責與職掌劃分之擬議。分層負責明細表之擬議。
- 職務歸系
- 職務之設置、調整、變更、註銷、歸系案件之擬議。
- 職務說明書之擬議。
- 任免遷調
- 薦任以下人員之任免遷調案件。
- 約僱人員之僱用與解雇之擬議。
- 離職人員異動通知之核填事項。
- 職員任審、動態或複審案件之擬報。
- 職員試用期滿成績考核案件之擬報。
- 考試及格分發人員報到情形之填報。
- 薦任主管以上人員之任免遷調案件。
- 年度用人計畫及考試分發案件之擬議。
- 委任人員之請任案件。職員缺額之查報。
- 職員任審、動態或複審案件審定之轉知及登記。
- 機關首長之兼職案件。職名章、職員證之製發。
- 俸級銓定後薪津之通知。薦任以上人員之請任案件。
- 獎懲
- 職員獎懲案件之擬議與核定。
- 違法糾舉彈劾移送懲戒案件之擬議。
- 停職、復職、免職、解雇案件之擬議。
- 控訴案件之調查與擬議。模範公務人員之遴選保薦。
- 考績(成)
- 考績(成)考績通知書之填發及登記。
- 考績(成)之核定及報備。職員平時考核案件之處理。
- 職員進修
- 遴調職員參加各種訓練之核派。
- 參加訓練進修各項補助費之核發。
- 薦送國內部分時間進修、研習案件。
- 職員訓練進修計畫之擬訂。薦送帶職帶薪全時進修案件。
- 財務保證
職員經管財務應行辦理保證事項。
- 辦公時間
辦公時間變更之擬議。
- 員工出國
- 出國考察進修計畫之擬議。
- 因公出國人員護照之申請。
- 員工出國旅遊、探親案件之核辦。
- 差假勤惰管理
- 職員出勤管理及差假登記。
- 職員不休假加班費之申請案件。
- 員工國內外休假旅遊補助費之申請案件。
- 退休、資遣、撫恤
- 屆臨退休人員之列管及查報。
- 退休資遣案件之擬報。職員撫恤案件之擬報。
- 撫恤核定案件之轉知及撫卹金之核算、發給。
- 退休資遣核定案件之轉知及退休金資遣費之核算、發給。
- 退休人員及在職亡故遺族之照護(三節慰問金與特別濟助金請發)。
- 福利互助及保險
- 申請輔建購宅貸款案件之擬辦。
- 員工康樂活動事項。眷舍房地處理案件。
- 公務人員保險及各項福利互助案件之辦理。
- 公務人員保險及福利互助各項給付之轉發。
- 全民健康保險及退撫基金有關事項之擬辦。
- 待遇
- 公務人員各項待遇案件。
- 各項加給、補助津貼、獎金案件之辦理。
- 因案停職、留職停薪人員復職復薪、回職復薪後薪津之核發。
- 人事資料及報表
- 公務人員各項待遇案件。
- 各項加給、補助津貼、獎金案件之辦理。
- 因案停職、留職停薪人員復職復薪、回職復薪後薪津之核發。
- 行政革新
參與暨建議制度、人力規劃、工作簡化等執行與成果之陳報。
政風室
安全維護工作之策劃與執行。協助處理陳情請願。
- 政風組織管理
政風人員之任免、遷調及考核。
- 政風工作
- 公職人員財產申報之審議。
- 政風法令宣導。政風興革建議。
- 政風考核、獎懲建議。政風案件之預防及查處。
- 公務機密維護
公務機密維護之策劃與推行。洩密案件調查與處理。
- 機關安全維護
主計室
- 歲計
- 年終保留經費之彙辦。
- 追加及變更預算。年度決算。
- 財務狀況之分析及週報表之編報。
- 預算科目間流用。 特別支出款項之請款。
- 編製概(預)算及分配預算與績效報告分期實施計畫收支估計表。
- 會計帳務
- 成本之計算。
- 帳務及會計憑證之銷毀。
- 帳務及會計憑證之整理、保管。
- 有關經費收支轉帳傳票之編製。
- 行政經費會計報告及支付憑證之編送。
- 事業及基金會計月報試算表暨其附表之編報。
- 稽查及內部審查
- 會同擬議各項費率調整。
- 現金及財務盤點之簽報。
- 各項財物毀損及損耗之審核。
- 公款支付期限之檢查與簽報事項。
- 支付法案之核定。憑證書據之審核。
- 倉儲物資會同抽查。各項採購之監辦。
- 各級農會代辦各項業務之財務作業情形之查核。
台北辦事處
負責台北市、新北市、基隆市
- 農作物產銷穩定措施之執行、協調及督導事項。
- 農糧產業資訊蒐集、經濟分析及預測事項。
- 農糧產業天然災害救助之執行、協調及督導事項。
- 農糧產品批發市場改善、零售現代化與直銷之執行、協調及督導事項。
- 農藥、肥料、種苗與農機檢查及肥料運銷業務之執行及督導事項。
- 糧食收購、儲運、碾製及配撥事項。
- 糧商管理與糧食調節之執行及協調事項。
- 稻米分級檢驗之執行及協調事項。
新竹辦事處
負責新竹縣、新竹市
- 農作物產銷穩定措施之執行、協調及督導事項。
- 農糧產業資訊蒐集、經濟分析及預測事項。
- 農糧產業天然災害救助之執行、協調及督導事項。
- 農糧產品批發市場改善、零售現代化與直銷之執行、協調及督導事項。
- 農藥、肥料、種苗與農機檢查及肥料運銷業務之執行及督導事項。
- 糧食收購、儲運、碾製及配撥事項。
- 糧商管理與糧食調節之執行及協調事項。
- 稻米分級檢驗之執行及協調事項。
苗栗辦事處
負責苗栗縣
- 農作物產銷穩定措施之執行、協調及督導事項。
- 農糧產業資訊蒐集、經濟分析及預測事項。
- 農糧產業天然災害救助之執行、協調及督導事項。
- 農糧產品批發市場改善、零售現代化與直銷之執行、協調及督導事項。
- 農藥、肥料、種苗與農機檢查及肥料運銷業務之執行及督導事項。
- 糧食收購、儲運、碾製及配撥事項。
- 糧商管理與糧食調節之執行及協調事項。
- 稻米分級檢驗之執行及協調事項。